Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHDQ96IW2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHDQ96IW2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms