Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCARF2Q96GP6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SCARF2Q96GP6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms