Protein–RNA interactions for Protein: Q96DA2

RAB39B, Ras-related protein Rab-39B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39BQ96DA2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB39BQ96DA2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB39BQ96DA2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms