Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP4CQ96CF2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms