Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VOPP1Q96AW1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VOPP1Q96AW1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VOPP1Q96AW1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms