Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GTF3C6Q969F1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
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