Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFT2D1Q8WV19 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms