Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DCAF4Q8WV16 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms