Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2AF1L4Q8WU68 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
U2AF1L4Q8WU68 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms