Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF30

WHAMM, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMQ8TF30 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
WHAMMQ8TF30 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WHAMMQ8TF30 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
WHAMMQ8TF30 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms