Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBA3Q8TBC4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms