Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAC9

SCAMP5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP5Q8TAC9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP5Q8TAC9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP5Q8TAC9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP5Q8TAC9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP5Q8TAC9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP5Q8TAC9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP5Q8TAC9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP5Q8TAC9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCAMP5Q8TAC9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP5Q8TAC9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP5Q8TAC9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP5Q8TAC9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP5Q8TAC9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP5Q8TAC9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP5Q8TAC9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCAMP5Q8TAC9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAMP5Q8TAC9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SCAMP5Q8TAC9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms