Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDPRQ8NCN5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDPRQ8NCN5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms