Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V2

TRIML1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML1Q8N9V2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIML1Q8N9V2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIML1Q8N9V2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms