Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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TMCO5AQ8N6Q1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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TMCO5AQ8N6Q1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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TMCO5AQ8N6Q1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMCO5AQ8N6Q1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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TMCO5AQ8N6Q1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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TMCO5AQ8N6Q1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMCO5AQ8N6Q1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMCO5AQ8N6Q1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMCO5AQ8N6Q1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMCO5AQ8N6Q1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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TMCO5AQ8N6Q1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMCO5AQ8N6Q1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMCO5AQ8N6Q1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMCO5AQ8N6Q1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMCO5AQ8N6Q1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMCO5AQ8N6Q1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMCO5AQ8N6Q1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMCO5AQ8N6Q1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMCO5AQ8N6Q1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TMCO5AQ8N6Q1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMCO5AQ8N6Q1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMCO5AQ8N6Q1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMCO5AQ8N6Q1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMCO5AQ8N6Q1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMCO5AQ8N6Q1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMCO5AQ8N6Q1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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