Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME8Q8N427 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NME8Q8N427 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NME8Q8N427 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
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