Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZV2

CMTM8, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM8Q8IZV2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CMTM8Q8IZV2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMTM8Q8IZV2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMTM8Q8IZV2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMTM8Q8IZV2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CMTM8Q8IZV2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMTM8Q8IZV2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMTM8Q8IZV2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMTM8Q8IZV2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMTM8Q8IZV2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMTM8Q8IZV2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMTM8Q8IZV2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMTM8Q8IZV2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMTM8Q8IZV2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMTM8Q8IZV2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CMTM8Q8IZV2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM8Q8IZV2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CMTM8Q8IZV2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMTM8Q8IZV2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMTM8Q8IZV2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMTM8Q8IZV2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMTM8Q8IZV2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms