Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUZ0

LRRC49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC49Q8IUZ0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC49Q8IUZ0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC49Q8IUZ0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC49Q8IUZ0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC49Q8IUZ0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC49Q8IUZ0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC49Q8IUZ0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC49Q8IUZ0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC49Q8IUZ0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC49Q8IUZ0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC49Q8IUZ0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC49Q8IUZ0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC49Q8IUZ0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC49Q8IUZ0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC49Q8IUZ0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC49Q8IUZ0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC49Q8IUZ0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC49Q8IUZ0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC49Q8IUZ0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC49Q8IUZ0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC49Q8IUZ0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC49Q8IUZ0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC49Q8IUZ0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC49Q8IUZ0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC49Q8IUZ0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC49Q8IUZ0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC49Q8IUZ0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC49Q8IUZ0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRC49Q8IUZ0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRC49Q8IUZ0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC49Q8IUZ0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms