Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC84Q86UT8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC84Q86UT8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms