Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPAINQ86UA6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPAINQ86UA6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPAINQ86UA6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
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