Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
YTHDF3Q7Z739 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YTHDF3Q7Z739 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms