Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMC3Q7Z5M5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMC3Q7Z5M5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms