Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACAD11Q709F0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms