Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RFX8Q6ZV50 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFX8Q6ZV50 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFX8Q6ZV50 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms