Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFAP47Q6ZTR5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CFAP47Q6ZTR5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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