Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC55Q6ZSA7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC55Q6ZSA7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms