Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC129Q6ZRS4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC129Q6ZRS4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms