Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GBP6Q6ZN66 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms