Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SAMD1Q6SPF0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAMD1Q6SPF0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAMD1Q6SPF0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms