Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZBED9Q6R2W3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZBED9Q6R2W3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms