Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOA5Q6Q788 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOA5Q6Q788 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms