Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UFSP1Q6NVU6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UFSP1Q6NVU6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms