Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUM9

RETSAT, All-trans-retinol 13,14-reductase, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETSATQ6NUM9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RETSATQ6NUM9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RETSATQ6NUM9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms