Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRAMD4Q6IC98 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms