Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MCTP1Q6DN14 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCTP1Q6DN14 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms