Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATRNL1Q5VV63 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATRNL1Q5VV63 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ATRNL1Q5VV63 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATRNL1Q5VV63 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATRNL1Q5VV63 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATRNL1Q5VV63 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATRNL1Q5VV63 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATRNL1Q5VV63 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATRNL1Q5VV63 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATRNL1Q5VV63 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATRNL1Q5VV63 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATRNL1Q5VV63 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATRNL1Q5VV63 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATRNL1Q5VV63 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATRNL1Q5VV63 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATRNL1Q5VV63 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATRNL1Q5VV63 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATRNL1Q5VV63 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATRNL1Q5VV63 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATRNL1Q5VV63 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATRNL1Q5VV63 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATRNL1Q5VV63 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATRNL1Q5VV63 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATRNL1Q5VV63 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATRNL1Q5VV63 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms