Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf53Q5VUE5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf53Q5VUE5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms