Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EEF1A1P5Q5VTE0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
EEF1A1P5Q5VTE0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms