Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATAD3CQ5T2N8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAD3CQ5T2N8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAD3CQ5T2N8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAD3CQ5T2N8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAD3CQ5T2N8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAD3CQ5T2N8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATAD3CQ5T2N8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAD3CQ5T2N8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAD3CQ5T2N8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAD3CQ5T2N8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAD3CQ5T2N8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAD3CQ5T2N8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAD3CQ5T2N8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAD3CQ5T2N8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAD3CQ5T2N8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAD3CQ5T2N8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATAD3CQ5T2N8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms