Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NHSL1Q5SYE7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NHSL1Q5SYE7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NHSL1Q5SYE7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NHSL1Q5SYE7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NHSL1Q5SYE7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NHSL1Q5SYE7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NHSL1Q5SYE7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NHSL1Q5SYE7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NHSL1Q5SYE7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NHSL1Q5SYE7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NHSL1Q5SYE7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NHSL1Q5SYE7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NHSL1Q5SYE7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NHSL1Q5SYE7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NHSL1Q5SYE7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NHSL1Q5SYE7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NHSL1Q5SYE7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NHSL1Q5SYE7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NHSL1Q5SYE7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NHSL1Q5SYE7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NHSL1Q5SYE7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NHSL1Q5SYE7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NHSL1Q5SYE7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NHSL1Q5SYE7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms