Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM2

SNAPC4, snRNA-activating protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC4Q5SXM2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SNAPC4Q5SXM2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
SNAPC4Q5SXM2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SNAPC4Q5SXM2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SNAPC4Q5SXM2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SNAPC4Q5SXM2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SNAPC4Q5SXM2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
SNAPC4Q5SXM2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SNAPC4Q5SXM2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SNAPC4Q5SXM2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SNAPC4Q5SXM2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
SNAPC4Q5SXM2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SNAPC4Q5SXM2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SNAPC4Q5SXM2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SNAPC4Q5SXM2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SNAPC4Q5SXM2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SNAPC4Q5SXM2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SNAPC4Q5SXM2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SNAPC4Q5SXM2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SNAPC4Q5SXM2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SNAPC4Q5SXM2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SNAPC4Q5SXM2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SNAPC4Q5SXM2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SNAPC4Q5SXM2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SNAPC4Q5SXM2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SNAPC4Q5SXM2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SNAPC4Q5SXM2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SNAPC4Q5SXM2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SNAPC4Q5SXM2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SNAPC4Q5SXM2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms