Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COLEC12Q5KU26 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
COLEC12Q5KU26 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms