Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CT47A1Q5JQC4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CT47A1Q5JQC4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CT47A1Q5JQC4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms