Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAVIN4Q5BKX8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CAVIN4Q5BKX8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAVIN4Q5BKX8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms