Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC44A4Q53GD3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC44A4Q53GD3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms