Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARHGAP29Q52LW3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARHGAP29Q52LW3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms