Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GREB1Q4ZG55 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GREB1Q4ZG55 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms