Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPRNQ4KMQ1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPRNQ4KMQ1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPRNQ4KMQ1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
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