Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BBS9Q3SYG4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS9Q3SYG4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms