Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT71Q3SY84 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT71Q3SY84 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms